Основной задачей отдела является эффективное библиотечно-библиографическое обслуживание читателей. Фонд отдела составляет более 250 тыс. изданий. В состав фонда входит медицинская литература, книги по социально-экономическим и гуманитарным наукам, авторефераты, диссертации, периодические издания, фонд редких книг. Для обеспечения учебного и научного процессов на кафедрах созданы кафедральные библиотеки, работа которых курируется отделом научной литературы. 

Отдел обслуживает профессорско-преподавательский состав, других сотрудников академии, студентов и аспирантов, ординаторов, а также практических врачей города и области.

Читальный зал научной литературы предоставляет читателям книги, диссертации, авторефераты, профильные для вуза журналы, энциклопедии и словари. Зал оборудован компьютерами для работы с электронным каталогом и электронными приложениями к печатным учебникам.
Межбиблиотечный абонемент (МБА) выполняет запросы читателей на издания, отсутствующие в фонде библиотеки.

На научном абонементе и в читальном зале регулярно оформляются тематические выставки, выставки к знаменательным и памятным датам истории медицины и вуза.

Условия и сроки выдачи литературы определяются Правилами пользования библиотекой.